América Latina alberga un entorno único y una diversidad sin explotar
América Latina representa un modelo de estudio único dada la heterogeneidad y mezcla entre fuentes indígenas y otras fuentes continentales que contribuyen a la población actual.
​
Esta ascendencia está subrepresentada en la investigación actual y puede albergar patrones de expresión específicos de la población no descubiertos a nivel celular.
​
Las poblaciones latinoamericanas son muy diversas y están subestructuradas localmente, no sólo en su grado de mezcla continental sino también en sus componentes genéticos subcontinentales.
A Human Cell Map of Latin America Diversity
América Latina es una de las regiones más ricas del mundo en términos de diversidad étnica y mezcla genética entre pueblos indígenas y otras ascendencias continentales. Estos ancestros han estado subrepresentados en estudios de genómica y transcriptómica y pueden albergar patrones de expresión específicos de la población no descubiertos a nivel celular. Sin una caracterización de alta resolución de las poblaciones latinoamericanas poco estudiadas, el desarrollo de estrategias de medicina de precisión en la región será limitado y se perpetuarán las disparidades en salud.
Para abordar este desequilibrio, esta red tiene como objetivo construir un mapa celular latinoamericano de células sanguíneas inmunes y tipos de células de tejido de la vesícula biliar de diversas poblaciones indígenas y mestizas de siete países de América (México, Colombia, Perú, Chile, Brasil y latinos de EE. UU). Estos conjuntos de datos se utilizarán para identificar perfiles de expresión de ARN célula-específicos para complementar datos de cohortes de enfermedades relevantes para la epidemiología local de las comunidades participantes.
-
Generar una nueva Biored para el Human Cell Atlas centrada en la vesÃcula biliarInicialmente se recolectarán muestras de vesÃcula biliar de diferentes grupos étnicos de Chile mediante colecistectomÃas profilácticas, con el objetivo de generar un mapa completo de las céulas saludables de la vesÃcula.
-
Generar perfiles de ARN unicelular de tipos de células inmunes en poblaciones latinoamericanasGenerar un mapa completo de expresión génica de células inmunitarias sanguÃneas de diversas poblaciones nativas y de ascendencia mixta de América Latina, creado mediante el análisis de muestras de sangre periférica de diversas poblaciones.
-
Crear un portal comunitario latinoamericano para información, capacitación, intercambio, análisis y visualización de datos de genómica unicelularEl portal propuesto cubrirá diferentes audiencias y aspectos de la comunicación, participación y capacitación cientÃfica, basándose en conjuntos de datos scRNA-seq de América Latina creados durante este proyecto. También contará con una sección para el análisis de datos a través de un servidor web fácil de usar, facilitando la escalabilidad y confiabilidad de los flujos de trabajo de análisis de datos.
Resultados de la investigación compartidos con las comunidades participantes y la sociedad
LatinCells estará generando constantemente materiales educativos y de capacitación relacionados con la genómica unicelular y el análisis de datos. Estos materiales incluyen canales computacionales, pautas de capacitación y otros recursos para analizar, explorar y difundir el conocimiento y los resultados generados por nuestra iniciativa.
Investigadores Principales
Logramos construir un equipo compuesto 100% por latinoamericanos, con diferentes especialidades relacionadas con: participación comunitaria y muestreo; procesamiento de muestras y biología celular; análisis de datos y bioinformática; y educación tecnológica avanzada.
Andres Moreno-Estrada, MD, PhD
Cinvestav
México
Carla Gallo, MsC
Universidad Cayetano Heredia
Perú
Carlos Ortiz-Ramírez, PhD
Cinvestav
México
Daniela Robles-Espinoza, PhD
UNAM
México
Guillermo Barreto, PhD
Universidad del Valle
Colombia
Hugo Guerrero-Cazares, MD, PhD
Mayo Clinic
Estados Unidos
Lucía Spangenberg, PhD
Institut Pasteur de Montevideo
Uruguay
Patricia A. Possik, PhD
Instituto Nacional do Câncer
Brasil
Patricia Severino, PhD
Hospital Albert Einstein
Brasil
Ricardo Verdudo, VM, PhD
Universidad de Talca
Chile
Vinicius Maracaja-Coutinho, PhD
Universidad de Chile
Chile
La iniciativa LatinCells está financiada por la Chan Zuckerberg Initiative (CZI), a través del programa “Ancestry Networks for the Human Cell Atlas”.
Este programa de CZI apoya a los investigadores para que aporten datos de referencia unicelulares sanos procedentes de muestras de tejidos ancestralmente diversos al Human Cell Atlas, con el objetivo de crear un recurso más representativo a nivel mundial para comprender la salud y las enfermedades humanas.